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寧德:“芯”技術(shù)破解大黃魚“基因密碼”

2024年04月16日14:49 | 來源:閩東日報
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原標題:“芯”技術(shù)破解大黃魚“基因密碼”

技術(shù)人員在實驗

技術(shù)人員在實驗

4月15日,在海水養(yǎng)殖生物育種全國重點實驗室,技術(shù)人員忙著大黃魚育種的“芯”技術(shù)攻關(guān),力爭養(yǎng)出“最優(yōu)秀”的大黃魚。

大黃魚是我國特有的地方性海水魚類,曾居我國海洋“四大漁業(yè)”之首。20世紀70年代前,平均年捕撈量約12萬噸,但因過度捕撈越冬群體,致使大黃魚資源瀕臨枯竭。30多年來,寧德市通過科技支撐、品牌優(yōu)先、提質(zhì)養(yǎng)殖、做深加工、拓寬市場等舉措,寧德大黃魚已從瀕臨滅絕的物種發(fā)展成為如今年產(chǎn)值上百億元的富民產(chǎn)業(yè),不斷續(xù)寫大黃魚的“國魚傳奇”。

從瀕臨滅絕到人工育種養(yǎng)殖,最關(guān)鍵就是種苗。寧德泩泩漁業(yè)科技有限公司相關(guān)負責人陳佳介紹:“好的種苗是整個大黃魚產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展的根本。近年來,寧德市一直致力于良種場的建設(shè)和優(yōu)化,良種場為產(chǎn)業(yè)提供良種支持,滿足產(chǎn)業(yè)對養(yǎng)殖品種優(yōu)良性狀的需求?!?/p>

多年來,“白點病”是大黃魚養(yǎng)殖戶的心病,每年秋末、春初,是大黃魚群“白點病”的多發(fā)時期,一個大黃魚群感染后,死亡率少則30%,多則高達90%。對養(yǎng)殖戶來說,一旦發(fā)病,就意味著幾個月的養(yǎng)殖工作全部白費。

如何破題?廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院的徐鵬教授團隊運用芯片和大數(shù)據(jù)技術(shù),檢測大黃魚的基因,大黃魚育種從“芯”出發(fā)。

“面對嚴重危害大黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的刺激隱核蟲頑疾,自2016年起,我們和寧德企業(yè)合作勇闖‘無人區(qū)’,將抗刺激隱核蟲大黃魚選育作為第一個選育方向。”廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院副院長、海水養(yǎng)殖生物育種全國重點實驗室主任徐鵬說。

大黃魚的“白點病”,是由海水中的刺激隱核蟲引起的寄生蟲疾病。由于海水養(yǎng)殖環(huán)境具有開放性特征,很難杜絕刺激隱核蟲對養(yǎng)殖魚類的感染?!凹由先斯ゐB(yǎng)殖密度較高,很容易產(chǎn)生病害問題。”徐鵬說。

給大黃魚喂藥?不太好。農(nóng)殘超標危害消費者身體健康,還可能導(dǎo)致整個產(chǎn)業(yè)被市場淘汰。在感染魚群中挑出存活大黃魚進一步繁殖?有風險。感染后存活下來的大黃魚并不天然具有抗病性,相反還可能成為攜帶者,在接下來的選育中傳染給整個魚群。

徐鵬選擇換一種解決思路:用全基因組選育的方法,先給大黃魚“出題”,再用芯片選出大黃魚里的“優(yōu)等生”。團隊收集并孵化出了“白點病”的感染源——刺激隱核蟲的幼蟲。

在寧德大黃魚育種基地,徐鵬團隊用這些寄生蟲對健康的大黃魚進行人工感染。人工感染后的結(jié)果顯示,在大黃魚養(yǎng)殖群體的內(nèi)部,存在對刺激隱核蟲感染抗性的個體差異和多態(tài)性。也就是說,確實存在“成績好”的大黃魚,它們沒有被感染或感染程度較低,這些“成績好”的大黃魚,正是徐鵬及其團隊所要尋找的“優(yōu)等生”。

可是,又該如何在不感染魚群的情況下,直接找出大黃魚里的“優(yōu)等生”呢?

從2016年開始,徐鵬教授團隊與寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司開展產(chǎn)學(xué)合作,依托大黃魚育種國家重點實驗室(經(jīng)重組成為現(xiàn)在的“海水養(yǎng)殖生物育種全國重點實驗室”)平臺,聯(lián)合開發(fā)了“寧芯”系列大黃魚基因組育種芯片。

由二氧化硅制作而成的小小芯片上,分布著幾十萬個DNA探針。將從魚鰭中提取的DNA放在芯片上檢測,就能快速準確地獲取大黃魚幾十萬個基因位點的信息。“這些基因位點,就是抗性大黃魚的‘遺傳密碼’。”徐鵬說。

芯片的開發(fā),幫助團隊進行大黃魚海量基因型的準確鑒定,大大提高了大黃魚抗“白點病”新品系選育工作的準確性和效率。借助于超級計算機和育種算法,大黃魚“優(yōu)等生”的秘密得以破解。

2018年12月7日,徐鵬課題組和大黃魚育種國家重點實驗室的工作人員一起,篩選出具有抗“白點病”能力的大黃魚親魚,繁殖抗病后代。

8個月后,他們驗證了利用基因組選擇育種獲得的選育后代的抗蟲性能,抗蟲選育系的后代存活率顯著提升35.57%。此前通過全基因組選育技術(shù)篩選抗病大黃魚的努力,收獲了階段性成功。

2021年底,寧德市大黃魚育種團隊進一步開發(fā)了完全國產(chǎn)化、自主可控、經(jīng)濟高效的“寧芯3號”液相育種芯片。截至2023年底,已在省內(nèi)外11家大黃魚育種單位推廣應(yīng)用,檢測量超過16000份,實現(xiàn)了大黃魚基因組育種的全面“芯片化”,大大推進大黃魚良種選育的高速發(fā)展。

科技創(chuàng)新成果如何惠及企業(yè)和千家萬戶?產(chǎn)學(xué)研融合發(fā)展是必由之路。近年來,寧德市十分重視大黃魚相關(guān)科研成果的轉(zhuǎn)化,通過與企業(yè)共建平臺、政策補助、技術(shù)推廣等舉措,推動大黃魚產(chǎn)業(yè)產(chǎn)學(xué)研融合發(fā)展。2014年,獲科技部批準建設(shè)大黃魚育種國家重點實驗室,在魚類基因資源開發(fā)、遺傳工具構(gòu)建、種質(zhì)資源遺傳評價、重要經(jīng)濟性狀遺傳基礎(chǔ)解析、基因組選擇育種技術(shù)創(chuàng)新等方面取得一系列研究成果。

通過政府部門、企業(yè)和科研人員的共同努力,全市水產(chǎn)原良種體系初步形成,全市建有市級以上原良種場7家、全國現(xiàn)代種業(yè)示范場2家,并擁有全國唯一的國家級大黃魚原種場。與廈門大學(xué)、集美大學(xué)等合作建設(shè)大黃魚育種國家重點實驗室和國家級大黃魚遺傳育種中心,與東海水產(chǎn)研究所共建創(chuàng)新研究院。大黃魚新品種研發(fā)取得初步成效,大黃魚新品種和新品系的選育得到突破,“富發(fā)1號”大黃魚新品種通過全國水產(chǎn)原種和良種審定委員會審定。2022年,在寧德市委、市政府領(lǐng)導(dǎo)下,大黃魚育種國家重點實驗室成功優(yōu)化重組為海水養(yǎng)殖生物育種全國重點實驗室,成為福建省首個獲批建設(shè)的全國重點實驗室,也是目前我國在水產(chǎn)育種領(lǐng)域獲批的兩個全國重點實驗室之一。

近年來,寧德市在海水養(yǎng)殖生物育種全國重點實驗室等國家級科技創(chuàng)新平臺上,建立了大黃魚基因組選擇、基因編輯育種、病害綜合防控和預(yù)警技術(shù)體系,研發(fā)了“寧芯”系列大黃魚基因組育種芯片,先后培育出大黃魚“富發(fā)1號”等水產(chǎn)新品種,選育了“寧抗1號”“寧抗2號”等大黃魚抗病新品系,在國際頂級期刊發(fā)表論文300余篇,獲得發(fā)明專利30余項,制定發(fā)布國家標準1個、行業(yè)標準4個、團體標準1個、企業(yè)標準13個,有力推動了以大黃魚為主的海水養(yǎng)殖魚類的種業(yè)科技創(chuàng)新和良種化進程。

好種半年糧。通過育苗業(yè)者近20年不斷努力,寧德大黃魚養(yǎng)殖群體種質(zhì)明顯提升,二齡養(yǎng)成魚的體重從2000年的平均350克提高到目前的550克。大黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)量已連續(xù)9年居全國海水養(yǎng)殖魚類之首,是全國最大規(guī)模的網(wǎng)箱養(yǎng)殖和最暢銷的海水魚類。如今,寧德大黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)量占全國總產(chǎn)量的80%以上,寧德已發(fā)展成為全國最大的海水魚人工繁育和網(wǎng)箱養(yǎng)殖基地。(記者 張文奎 通訊員 盧楊靜)

(責編:江葦杭、劉卿)

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